登録免許税とは?不動産登記の税率・計算方法と軽減措置の期限

公認会計士・税理士 監修

この記事は、公認会計士・税理士が代表を務める札幌の会計事務所「ジェイスタート会計事務所」が監修しています。

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登録免許税とは、不動産や会社の登記を受けるときに国に納める税金です。不動産の登記では、原則として売買価格ではなく固定資産税評価額に税率をかけて計算します。土地の売買は1.5%(2029年3月31日まで)、自分が住む住宅用家屋の保存・移転・抵当権設定は軽減税率(2027年3月31日まで)を使えます。

執筆:ジェイスタート会計事務所 編集部(札幌の公認会計士・税理士事務所)2026年10月時点の法令に基づき作成

この記事の結論

登録免許税は「課税標準×税率」で計算し、不動産の所有権の登記なら課税標準は固定資産税評価額です。軽減税率には期限と要件があるため、登記の前に使えるかを確認します。

  • 土地の売買による所有権の移転は1.5%(2029年3月31日まで)
  • 自分が住む住宅用家屋は、保存0.15%・売買による移転0.3%・住宅ローンの抵当権設定0.1%(2027年3月31日まで。住宅用家屋証明書が必要)
  • 評価額100万円以下の土地の相続登記は免税(2027年3月31日まで)
  • 会社の設立は資本金の0.7%(株式会社は最低15万円、合同会社は最低6万円)。札幌市内で特定創業支援等事業を受けると半分になる
  • 登記の申請と同時に、収入印紙か現金納付の領収証書で納める
目次

登録免許税とは?どんな登記にかかる税金か

登録免許税は、登記・登録・免許などを受けるときにかかる国税です。身近なのは、土地や建物を買った・建てた・相続したときの不動産登記と、会社を設立したり役員を変えたりしたときの商業登記です。登記を受ける人が納め、売買のように登記を受ける人が複数いる場合は、連帯して納める義務を負います。

登記の種類必要になる場面課税標準(税率をかける元の金額)
建物の表題登記新築した建物の所在・構造・床面積を初めて登記する登録免許税はかからない
所有権の保存登記新築した建物の所有者を初めて登記する固定資産税評価額(評価額がなければ法務局が定める基準で認定した価格)
所有権の移転登記売買・相続・贈与などで土地や建物を取得した固定資産税評価額
抵当権の設定登記住宅ローンなどの借入で不動産を担保に入れた債権金額(借入額)
会社の設立登記株式会社・合同会社を設立した資本金の額
登録免許税がかかる主な登記と課税標準(2026年10月時点)

登録免許税の計算方法と主な税率は?

不動産の所有権の登記では、売買価格ではなく、市区町村の固定資産課税台帳に登録された価格(固定資産税評価額)が課税標準です。住宅用地の特例で下がった固定資産税の「課税標準額」ではなく、特例を当てる前の評価額を使う点に注意します。評価額は、毎年届く固定資産税の納税通知書の課税明細書や、市区町村で取る評価証明書で確認できます。

登記の内容税率期限・要件
土地の売買による所有権の移転1.5%2029年3月31日まで
住宅用家屋の所有権の保存0.15%2027年3月31日まで。自分が住む家屋で、住宅用家屋証明書を添付
住宅用家屋の売買による所有権の移転0.3%同上
住宅の取得のための借入の抵当権の設定0.1%同上
評価額100万円以下の土地の相続による所有権の移転免税2027年3月31日まで
株式会社・合同会社の設立資本金の0.7%最低額は株式会社15万円、合同会社6万円
特定創業支援等事業を受けた会社の設立(札幌市内)資本金の0.35%最低額は株式会社7.5万円、合同会社3万円。証明書の有効期限は2027年3月31日
主な登記の税率(2026年10月時点)。相続・贈与による移転、住宅以外の建物の売買などの本則の税率は、国税庁タックスアンサーNo.7191の税額表で確認できます

計算例:中古住宅を住宅ローンで買った場合

例えば、自分が住むための中古住宅を買い、土地の評価額が1,200万円、建物の評価額が600万円、住宅ローンが2,500万円で、建物と抵当権の軽減の要件を満たす場合です。

  • 土地の所有権の移転:1,200万円×1.5%=18万円
  • 建物の所有権の移転(住宅用家屋の軽減):600万円×0.3%=18,000円
  • 抵当権の設定(住宅ローンの軽減):2,500万円×0.1%=25,000円
  • 合計:18万円+18,000円+25,000円=223,000円

実際の計算では、課税標準と税額にそれぞれ端数の処理があります。建物が軽減の要件を満たさない場合は、建物の移転と抵当権の設定に本則の税率がかかり、税額が大きくなります。

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登録免許税を登記の種類別に計算する売買・相続・贈与・保存・抵当権など、登記の種類と評価額を選んで税額の目安を確認できます。計算する

住宅の登記で軽減税率を使うには?要件と住宅用家屋証明書

住宅用家屋の軽減税率は、自分が住むための家屋であること、床面積などの要件を満たすこと、新築や取得から一定の期間内に登記することなどが条件です。中古住宅は、耐震性の基準を満たすことも求められます。要件を満たすことは、市区町村が発行する住宅用家屋証明書を登記の申請書に添付して示します。

  • 自分が住むための家屋か(貸家や事務所は対象外)
  • 床面積や建築時期、耐震性の要件を満たすか
  • 新築・取得から定められた期間内に登記するか
  • 登記の前に住宅用家屋証明書を取ったか(登記の後に出しても軽減は受けられない)
  • 抵当権の軽減は、住宅を取得するための借入か

住宅用家屋の軽減は2027年3月31日までの登記が対象です。延長するかどうかは2026年10月時点では要望の段階で、令和9年度の税制改正で決まります。引渡しや登記の時期がこの日付の前後になる場合は、早めに日程を確認しておきます。

不動産取得税は別にかかる

不動産を取得すると、登録免許税とは別に、都道府県の税金である不動産取得税がかかります。登記のときに納める登録免許税と違い、不動産取得税は取得の後に北海道から届く納税通知書で納めます。

項目登録免許税不動産取得税(北海道)
税金の種類国税道税
納める時期登記の申請のとき取得の後、納税通知書が届いてから
税率登記の種類ごとに決まる土地・住宅3%、住宅以外の家屋4%
相続で取得したときかかる(評価額100万円以下の土地は2027年3月31日まで免税)かからない
主な軽減土地の売買1.5%、住宅用家屋の軽減税率宅地の課税標準を2分の1(2027年3月31日までの取得)、新築住宅の1,200万円控除(2026年4月1日以後の取得は床面積40〜240㎡)
登録免許税と不動産取得税の違い(2026年10月時点)。不動産取得税の免税点は、2026年4月1日以後の取得で土地16万円、新築等の家屋66万円、売買等の家屋34万円

不動産取得税の計算と申告の流れは不動産取得税の基本と関連する手続きで詳しく紹介しています。

相続登記の登録免許税はいくら?免税措置と申請義務

相続で土地や建物を取得したときも、固定資産税評価額を課税標準として登録免許税がかかります。相続による移転の税率は、売買や贈与による移転より低く定められています。相続人が何人いるかで税率が変わることはありませんが、相続人以外の人が遺贈で取得する場合は税率が異なります。

2027年3月31日までは、1筆ごとの評価額が100万円以下の土地の相続登記は免税です。山林や原野、郊外の小さな土地などが対象になりやすく、申請書に免税の根拠となる規定を書いて申請します。

相続登記は放置しない

相続で不動産を取得した人には、相続登記の申請が義務づけられており、正当な理由なく怠ると過料の対象になることがあります。申請の期限や必要な書類(戸籍謄本、遺産分割協議書など)は、法務局の案内で確認してください。登記を後回しにするほど、相続人が増えて書類集めが難しくなります。

相続税の申告と相続登記は、どちらも遺産分割の内容をもとに進め、戸籍などの書類も共通するため、並行して準備すると効率的です(相続税の土地の評価は路線価などを使うため、登録免許税の評価額とは異なります)。不動産の相続でよくある疑問は不動産・資産税のよくある質問にまとめています。

会社設立の登録免許税はいくら?半額にできる場合

株式会社・合同会社の設立登記では、資本金の0.7%が登録免許税で、株式会社は最低15万円、合同会社は最低6万円です。資本金が小さく、0.7%で計算した額が最低額に届かない会社は、株式会社15万円・合同会社6万円がそのまま設立時の税額になります。設立の後も、役員の変更や本店の移転、増資などの登記ごとに登録免許税がかかります。

特定創業支援等事業を使って設立する場合

札幌市内で会社を設立する前に、札幌中小企業支援センターや札幌商工会議所で、1か月以上・4回以上にわたり経営・財務・人材育成・販路開拓の4分野の支援を受けて証明書を取得します。すると、登録免許税が0.7%から0.35%になります(株式会社の最低額15万円→7.5万円、合同会社6万円→3万円)。証明書の有効期限は2027年3月31日です。

市には、さっぽろ新規創業促進補助金(株式会社75,000円・合同会社30,000円)もあります。募集期間は2026年4月1日〜2027年3月31日で、設立から90日以内か2027年3月31日の早い日までに申請します。対象となる要件は市の案内で確認してください。

支援の受け方と証明書の取り方は特定創業支援等事業で会社設立の登録免許税を半額にする方法で詳しく説明しています。

登録免許税は経費になる?

場面税務上の扱い
会社の設立登記創立費(繰延資産)として、任意の時期に償却して損金にできる
法人が事業用の不動産を取得したときの登記取得価額に含めず、その期の損金にできる(取得価額に含めることもできる)
個人事業主が事業用の不動産を取得したときの登記その年の必要経費にできる
自宅を取得したときの登記経費にはならず、将来売却したときの取得費に含める
登録免許税の税務上の扱い(2026年10月時点の一般的な取扱い)

事業用の不動産の取得や法人化に伴う登記では、登録免許税をいつ・どう経費にするかで税額が変わります。初回無料で確認できます。

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登録免許税はいつ・どうやって納める?手続きの流れ

登録免許税は、登記の申請と同時に納めます。金融機関などで現金で納付して領収証書を申請書に貼る方法と、収入印紙を申請書に貼る方法があり、オンラインで申請する場合は電子納付も使えます。不動産の登記は、通常は次の流れで進みます。

  1. 評価額を確認する固定資産税の課税明細書か評価証明書で、土地と建物の評価額を確認します。
  2. 軽減の要件と証明書を確かめる住宅用家屋証明書や特定創業支援等事業の証明書など、軽減に必要な書類を登記の前に取ります。
  3. 必要書類をそろえる売買なら契約書や登記識別情報、相続なら戸籍謄本や遺産分割協議書、会社設立なら定款などを準備します。
  4. 申請書を作って納付する登記申請書に課税標準と税額を書き、収入印紙を貼るか、現金納付の領収証書を貼ります。
  5. 法務局に申請する窓口への持参、郵送、オンラインのいずれかで申請し、完了後に登記識別情報などを受け取ります。

登記の手続きは司法書士に依頼するのが一般的です。登記にかかる費用は、登録免許税(実費)、司法書士の報酬、証明書の取得費用などの合計で、報酬は登記の種類や物件の数、書類集めの手間で変わります。見積りでは、登録免許税と報酬が分けて書かれているかを確認すると比べやすくなります。

よくある質問

不動産の売買では、登録免許税は売主と買主のどちらが払いますか?

所有権の移転登記は売主と買主が共同で申請し、法律上は連帯して納める義務を負います。実務では、売買契約で買主が負担すると定めるのが一般的です。売主の住宅ローンの抵当権を消す抹消登記の費用は、売主が負担するのが一般的です。

新築の建物で固定資産税評価額がまだない場合はどうなりますか?

評価額が決まっていない新築の建物は、法務局が定める基準で認定した価格を課税標準にして計算します。建物の構造や床面積によって価格が決まるため、建築会社や司法書士に事前に見込みを確認しておくと安心です。

相続登記を自分で申請すると、登録免許税は安くなりますか?

登録免許税の額は、自分で申請しても司法書士に頼んでも同じです。違いは司法書士の報酬がかかるかどうかで、相続人が多い場合や遺産分割が複雑な場合は、書類の不備で手続きが長引かないよう専門家に頼む方法もあります。

軽減税率の期限が過ぎたらどうなりますか?

期限までに延長が決まらなければ、期限の後の登記には本則の税率がかかります。住宅用家屋の軽減の期限は2027年3月31日、土地の売買の1.5%は2029年3月31日です。延長の有無は税制改正で決まるため、登記の時期が近づいたら最新の情報を確認します。

まとめ

登録免許税は登記を受けるときに納める国税で、不動産の登記では固定資産税評価額に税率をかけて計算します。土地の売買1.5%(2029年3月31日まで)、住宅用家屋の軽減税率と100万円以下の土地の相続登記の免税(2027年3月31日まで)には期限があります。要件とあわせて確認してから、登記の日程を組みましょう。会社の設立は資本金の0.7%で、特定創業支援等事業の証明を受けて設立すると半額にできる場合があります。

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出典・参考(公的機関)

本記事は2026年10月時点の法令等に基づく一般的な解説です。個別の状況により取扱いが異なる場合がありますので、実際の申告・手続きは税理士等の専門家にご相談ください。

更新履歴:2026年10月 全面改訂(令和8年度税制改正を反映)

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