不動産管理会社の開業時の税務手続きと届出一覧|運営方式別の消費税と預り金

公認会計士・税理士 監修

この記事は、公認会計士・税理士が代表を務める札幌の会計事務所「ジェイスタート会計事務所」が監修しています。

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不動産管理会社の開業では、法人設立届出書や青色申告の承認申請などの届出を期限内に出すことが基本です。あわせて、管理委託・サブリース・所有のどの方式で運営するかを最初に決めることが重要です。方式によって消費税の区分と帳簿の作り方が変わり、預り家賃と敷金は預り金として管理します。

執筆:札幌の公認会計士・税理士(ジェイスタート会計事務所)2026年10月時点の法令に基づき作成

この記事の結論

届出は法人設立届出書と青色申告の承認申請を軸に期限内に出し、運営方式に合わせて「住宅家賃は非課税・管理料は課税」の区分と預り金の管理を最初から帳簿に組み込みます。

  • 運営方式(管理委託・サブリース・所有)で、売上・消費税・リスクの姿が変わる
  • 法人設立届出書は設立の日以後2か月以内。道税事務所と市町村にも設立の届出を出す
  • 青色申告の承認申請は期限が短く、設立登記が終わったらすぐに出す
  • 住宅の家賃は非課税、管理料・事務所や店舗の家賃・駐車場は課税。サブリースは課税売上割合に注意
  • 預り家賃・敷金は預り金で処理し、オーナー精算書と帳簿の残高を一致させる
目次

まず決めたい三つの運営方式

不動産管理会社の運営方式は三つあります。オーナーから管理料を受け取る管理委託方式、物件を一括で借り上げて転貸するサブリース方式、法人が物件そのものを所有する不動産所有方式です。売上の規模、消費税の計算、リスクの所在がそれぞれ異なります。

運営方式会社の売上になるもの消費税主なリスク・注意点
管理委託方式オーナーから受け取る管理料(回収した家賃は預り金)管理料は課税小さく始められる。管理料の水準と業務の実態を説明できるようにする
サブリース方式入居者からの転貸家賃(オーナーへの支払賃料は費用)住宅の転貸は非課税、店舗・事務所は課税空室リスクを会社が負う。実態のない契約は税務調査で否認されやすい
不動産所有方式所有する物件の家賃収入住宅は非課税、店舗・事務所・駐車場は課税取得時に不動産取得税・登録免許税がかかる。借入れと修繕の計画が必要
不動産管理会社の三つの運営方式(2026年10月時点の一般的な整理)

管理委託方式は売上が管理料だけなので、コンパクトに始められます。サブリース方式は空室リスクを法人が負う分、管理料率より大きな差益を取れる一方、実態のない契約は税務調査で否認されやすい類型です。

家族の物件を管理する資産管理会社として設立する場合は、オーナー(親など)との取引条件が妥当かどうかが問われます。管理料やサブリースの賃料は、実際に行う業務の内容に見合う水準に設定し、契約書と業務の記録を残しておきます。どの方式が合うかは、設立前に税理士へ相談する価値があります。

所有方式で個人の物件を法人に移すときの税金

個人の物件を法人に売って所有方式にする場合、個人には譲渡所得の課税が生じることがあり、法人には取得時の税金がかかります。物件ごとに試算してから、移す物件と時期を決めます。

税金主な税率など(2026年10月時点)
不動産取得税(北海道)土地・住宅3%、住宅以外の家屋4%。宅地は課税標準が2分の1(2027年3月31日までの取得)
登録免許税(売買による土地の所有権移転)1.5%(2029年3月31日まで)
譲渡所得(売った個人)その年の1月1日時点で所有期間5年超の長期は所得税15%・住民税5%、5年以下の短期は所得税30%・住民税9%(別に復興特別所得税)
固定資産税・都市計画税(札幌市)1.4%・0.3%。毎年1月1日時点の所有者に課税される
個人の物件を法人に移すときの主な税金

設立時の届出一覧

法人として開業する場合の主な届出は次のとおりです。国税の届出は、本店の所在地を管轄する税務署に出します。

届出提出先期限ポイント
法人設立届出書税務署設立の日以後2か月以内定款の写しなどを添付する
法人設立・設置の届出北海道(道税事務所)・市町村各自治体の定める期限まで電子申告(eLTAX)でも提出できる
青色申告の承認申請書税務署設立の日以後3か月を経過した日と、最初の事業年度終了の日のいずれか早い日の前日まで遅れると初年度は青色申告にならない
給与支払事務所等の開設届出書税務署開設の日から1か月以内役員報酬だけの支払いでも必要
源泉所得税の納期の特例の承認申請書税務署随時。提出した月の翌月末日までに通知がなければ、翌々月の納付分から適用給与の支払いを受ける人が常時10人未満の場合。1〜6月分は7月10日、7〜12月分は翌年1月20日に納付
消費税簡易課税制度選択届出書(選ぶ場合)税務署新たに事業を始めた課税期間は、その課税期間中インボイス登録の要否もこの時点で判断する
減価償却資産の償却方法の届出書(必要な場合)税務署最初の事業年度の確定申告書の提出期限まで届け出なければ法定の方法(器具備品などは定率法、建物・建物附属設備・構築物は定額法)
健康保険・厚生年金保険の新規適用届年金事務所設立後すみやかに法人は役員1人だけでも強制適用
不動産管理会社(法人)の設立時の主な届出(2026年10月時点。従業員を雇う場合は労働保険・雇用保険の手続きも必要)

青色申告の承認申請は期限が短く、忘れると初年度の赤字を翌期以降へ繰り越せません。青色申告の法人は欠損金を10年繰り越せるため、開業初年度に赤字になりやすい業態ほど、設立登記が終わったらすぐに提出するのが鉄則です。

個人で開業する場合の届出

届出提出先期限
個人事業の開業届出書税務署開業の日から1か月以内
所得税の青色申告承認申請書税務署その年の3月15日まで(1月16日以後に開業した場合は開業の日から2か月以内)
給与支払事務所等の開設届出書税務署開設の日から1か月以内
源泉所得税の納期の特例の承認申請書税務署随時(法人と同じ扱い)
個人事業税の事業開始の申告道税事務所道の定める期限まで(書類の名称と期限は道の案内で確認)
個人で不動産管理業を始める場合の主な届出

個人で始めて事業が軌道に乗ってから法人化する順番もあります。その場合の考え方は不動産管理会社の法人化のタイミングと判断基準で整理しています。

  • 事業計画と収支の見通し(管理戸数・管理料率・空室の想定)
  • 開業資金と自己資金の額
  • 設立届・青色申告の承認申請の準備
  • 会計ソフトと記帳の体制(オーナー別・物件別に管理できるか)
  • 事業用口座(自社の口座と預り金の口座を分ける)と、必要な登録・免許の確認

札幌市内で開業する場合

所轄の税務署は本店の所在地で決まります。例えば北区・東区は札幌北税務署、豊平区・南区・清田区は札幌南税務署の管轄です。中央区は西側の一部が札幌西税務署になるため、住所ごとに国税庁の管轄区域表で確認します。2026年7月10日からは、書面の届出を札幌業務センターへ郵送します(e-Taxや窓口への持参は所轄の税務署)。

市内で会社を設立する場合、特定創業支援等事業の証明書があると、登録免許税が株式会社15万円→7.5万円、合同会社6万円→3万円に軽減されます(証明書の有効期限は2027年3月31日)。さっぽろ新規創業促進補助金(株式会社75,000円・合同会社30,000円)は、設立から90日以内か2027年3月31日の早い日までの申請が必要で、対象の要件は市の案内で確認してください。

消費税とインボイスの注意点

住宅の家賃は非課税、管理料・事務所や店舗の家賃・駐車場収入は課税というのが基本の区分です。サブリース方式で住宅を転貸すると非課税売上が大きくなり、課税売上割合を通じて仕入税額控除に影響します。

収入の種類消費税ポイント
住宅の家賃・共益費非課税契約などで居住用と明らかな貸付け。貸付期間が1か月未満のものなどは課税
住宅の礼金・更新料、返還しない敷金非課税住宅の貸付けの対価として家賃と同じ扱い
事務所・店舗の家賃・共益費・礼金課税居住用以外の貸付けは課税
駐車場の賃料課税住宅に付随し、全戸に割り当てて家賃と別に料金を取らない場合などは非課税
オーナーから受け取る管理料課税オーナーが課税事業者ならインボイスを求められる
返還する敷金・保証金対象外預り金として管理し、収益に計上しない
不動産管理業の主な収入と消費税の区分(2026年10月時点の一般的な扱い)

オーナーが事業者であればインボイスの発行を求められるため、登録の要否も開業時に判断しておきましょう。住宅だけを貸している大家は仕入税額控除をしないため、管理料のインボイスを必要としないことが多いです。一方、店舗・事務所を貸している課税事業者のオーナーや法人のオーナーは、インボイスを求めてきます。

店舗や事務所の家賃を管理会社が回収する場合もあります。オーナーが登録事業者なら、管理会社がオーナーに代わって入居者にインボイスを交付する方法(代理交付や媒介者交付特例)も検討します。

設立直後の消費税の判定と簡易課税

資本金1,000万円未満で設立した法人は、基準期間がないため原則として1期目は免税事業者です。2期目は、1期目の特定期間の課税売上高と給与等の支払額によって課税事業者になることがあります。インボイス登録をすれば、その時点から課税事業者です。

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課税事業者になるかを判定する基準期間や特定期間の売上などから、消費税の課税事業者になるかを確認できます。判定する

簡易課税を選ぶ場合、不動産管理業や駐車場の賃貸などの不動産業は第6種(みなし仕入率40%)です。基準期間の課税売上高5,000万円以下が要件で、新たに事業を始めた課税期間はその課税期間中に届け出れば適用できます。2割特例は2026年9月30日を含む課税期間で終わり、それ以後に設立した法人は使えません。3割特例は個人事業者だけの制度(令和9・10年分)です。

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簡易課税の納税額を計算する単一の事業区分で、簡易課税による消費税の納税額を計算できます。計算する

物件の構成やオーナーの顔ぶれによって、インボイス登録の要否と有利な課税方式は変わります。初回無料で整理できます。

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預り家賃と敷金の経理

管理委託方式では、入居者から回収した家賃はいったん預り金として処理し、自社の収益には管理料だけを計上します。回収した家賃を売上に入れてしまうと、売上も消費税の判定も実態より大きく見えてしまいます。

仕訳例:家賃10万円を回収し、管理料5,000円を差し引いて送金する場合

例えば、入居者から家賃10万円を回収し、管理料5,000円(税込)を差し引いてオーナーへ送金する場合です。

  • 回収したとき:現金10万円/預り金10万円
  • 送金したとき:預り金10万円/現金95,000円・受取管理料5,000円
  • 送金額:10万円−5,000円=95,000円

受取管理料は消費税の課税売上です。税抜経理の場合は、5,000円を本体と仮受消費税に分けて記帳します。

敷金も預り金で管理し、退去時の精算で修繕費の負担分を差し引いて返還します。サブリース方式や所有方式で返還しない敷金(敷引き)がある場合は、返還しないことが確定した時点で収益に振り替えます。

毎月のオーナー精算書と帳簿の残高を一致させておくことが、税務調査にもオーナーとのトラブルにも効く基本動作です。科目ごとの仕訳は不動産管理業の仕訳事例集で確認できます。

預り金はオーナー別・物件別に管理する

預り金の勘定は、オーナーごと・物件ごとの補助科目に分け、預り金専用の口座で入出金すると残高の照合が楽になります。賃貸住宅管理業の登録をした事業者は、預かった家賃などを自社の財産と分けて管理することが求められます。

具体例:運営方式によって変わる消費税区分

同じ賃貸マンションを扱う場合でも、管理委託方式なら管理料(課税)だけを売上に計上すれば足ります。一方、サブリース方式では住宅家賃の受け取り(非課税)と、オーナーへの支払賃料の両方を管理する必要があります。課税・非課税の区分がより複雑になり、日々の記帳の手間も変わります。

計算例:月額家賃の合計100万円の住宅マンションを扱う場合

例えば、住宅の月額家賃の合計が100万円のマンションを、管理料率5%の管理委託方式か、オーナーへの支払賃料を家賃の90%とするサブリース方式で扱う場合です。

  • 管理委託方式:会社の売上は管理料100万円×5%=5万円(課税売上)。家賃100万円は預り金
  • サブリース方式:会社の売上は転貸家賃100万円(非課税売上)。オーナーへの支払賃料は100万円×90%=90万円(住宅の借上げのため非課税)
  • サブリース方式の差益:100万円−90万円=10万円

管理委託方式は課税売上が中心で、サブリース方式は売上の大半が非課税になります。サブリース方式では課税売上割合が下がり、修繕費や広告費にかかった消費税の多くが控除できなくなる点に注意します。

見落としやすいポイント

ポイント確認すること
管理委託契約書の消費税区分管理料の金額と消費税の記載が明確か。契約書と請求書・帳簿の区分を一致させる
敷金・保証金の返還債務将来返還する債務のため、収益に計上せず負債(預り金)として管理する
オーナーごとの精算書の保存複数のオーナーから受託する場合、オーナーごとの家賃精算書が税務調査の説明資料になる
共益費・駐車場収入の区分住宅の共益費は家賃と同じく非課税、店舗の共益費や独立した駐車場は課税。契約ごとに整理する
必要な登録・免許管理戸数が一定規模以上なら賃貸住宅管理業の登録、入居者の仲介もするなら宅地建物取引業の免許が必要。サブリースは特定賃貸借契約の規制も受ける
帳簿・書類の保存法人の帳簿書類は7年(欠損金が生じた事業年度は10年)保存。メールやネットで受け取った請求書は電子データのまま保存する
不動産管理会社が開業時に見落としやすいポイント

実務ワンポイント:運営方式の途中変更に備える

開業当初は管理委託方式で始めても、事業が拡大するとサブリース方式や不動産所有方式へ切り替えるケースもあります。運営方式を変更すると、消費税の区分や帳簿の勘定科目も見直しが必要です。変更を検討し始めた段階で税理士に相談しておくと、移行がスムーズです。

  • 定款の事業目的に、不動産の賃貸・管理・売買など新しい方式の事業が含まれているか
  • オーナーとの契約の切替(管理委託契約から一括借上げ契約へ)と、入居者への通知
  • 課税売上割合の変化と、簡易課税の届出(適用したい課税期間の初日の前日まで)
  • 物件を取得する場合の資金計画(不動産取得税・登録免許税・借入れ)
  • 勘定科目と補助科目の見直し(預り金から受取家賃・支払家賃へ)

よくある質問

家族の物件を管理する資産管理会社でも、同じ届出が必要ですか?

必要です。家族向けの会社でも、法人設立届出書・青色申告の承認申請・給与支払事務所等の開設届出書などの届出は同じです。家族を役員にして報酬を払う場合は、事業年度開始から3か月以内に改定する定期同額給与が原則のため、設立時に報酬額を決めておきます。

資本金はいくらにすればよいですか?

資本金1,000万円以上で設立すると、1期目から消費税の課税事業者になります。資本金等が1,000万円以下・従業者50人以下の法人は、札幌市内なら法人住民税の均等割が北海道と市を合わせて年7万円で、赤字でもかかります。設立の登録免許税は資本金の0.7%(最低額は株式会社15万円、合同会社6万円)です。

入居者から受け取る礼金や更新料は、誰の売上ですか?

管理委託方式では、礼金や更新料は物件を貸しているオーナーの収入で、管理会社は預り金として受け取り、精算書でオーナーに渡します。サブリース方式では、会社が貸主になるため会社の売上です。どちらの場合も、住宅分は消費税が非課税です。

オーナーへの精算書をインボイスとして使えますか?

発行者の名称と登録番号、取引年月日、取引の内容、税率ごとの合計額と適用税率、税率ごとの消費税額、相手の名称という記載事項を満たせば、精算書をそのままインボイスとして使えます。毎月の精算書の様式を整えておくと、別に請求書を発行する手間を省けます。

まとめ

不動産管理会社の開業は、運営方式(管理委託・サブリース・所有)を決めてから、法人設立届出書と青色申告の承認申請を期限内に出すことが柱です。住宅家賃は非課税・管理料は課税という区分と、預り家賃・敷金の預り金処理を最初から帳簿に組み込み、オーナー精算書と残高を毎月一致させましょう。方式の変更や物件の取得を考え始めたら、消費税と取得時の税金を早めに試算しておくと安心です。

札幌の公認会計士・税理士事務所

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出典・参考(公的機関)

本記事は2026年10月時点の法令等に基づく一般的な解説です。個別の状況により取扱いが異なる場合がありますので、実際の申告・手続きは税理士等の専門家にご相談ください。

更新履歴:2026年10月 全面改訂(令和8年度税制改正を反映)

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この記事の執筆・監修

札幌の税理士・公認会計士事務所「ジェイスタート会計事務所」の公認会計士・税理士が、記事を執筆・監修しています。AI×クラウド会計の活用から税務・決算・資金調達・経営改善まで、中小企業の実務に役立つ情報をお届けします。

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